El atentado se registró hacia las 3:15 de la mañana en el departamento de La Guajira cuando el tren llevaba el mineral para su embarque en Puerto Bolívar.
La carga explosiva fue detonada en un tramo de la línea y trabajadores apoyados por la Fuerza Pública revisan el recorrido para asegurarse de que no haya más artefactos.
El Cerrejón produce actualmente 15 millones de toneladas anuales y es la mina de carbón a cielo abierto más grande del mundo.
Ninguna organización se ha atribuido el atentado que, por otra parte, no produjo víctimas mortales ni heridos.