Morales es representante a la Cámara por el departamento de Antioquia y pertenece al Partido Liberal. En las elecciones de 2006 obtuvo su curul gracias a 23.612 votos a su favor.
La Sala Penal de la Corte abrió investigación preliminar en contra del representante en abril de 2008, después de que varios desmovilizados de las Auc mencionaran su nombre.
Morales Gil integra la Comisión VII de Cámara célula legislativa y es médico oncólogo de profesión.