Adicionalmente el Alto Tribunal le ordena pagar 40 salarios mínimos mensuales legales, es decir más de 18 millones de pesos, y lo condenó a la inhabilitación perpetua para el ejercicio de funciones públicas.
La célula legislativa advirtió también que el ex representante deberá pagar $102.397.778 por perjuicios materiales, como consecuencia de la conducta descuidada que tuvo como Presidente de la Cámara de Representantes en 1999, con respecto a dos contratos para la adquisición de papelería y formas continúas.
La Corte consideró que Emilio Martínez faltó a los deberes de vigilancia, supervisión y control que tenía como presidente de esa institución.