Muñoz Gómez, se graduó en la Universidad Externado de Colombia en Finanzas y Relaciones Internacionales y se especializó en Gerencia, Gobierno y Asusntos Públicos.
Durante el Gobierno de Andrés Pastrana, fue asesor de Juan Manuel Santos cuando se desempeñó como Ministro de Hacienda. Allí apoyó el manejo de las relaciones con los gobernadores, alcaldes e instituciones que hacen parte de los entes territoriales.
En la Administración del Distrito Capital fue asesor en el Gobierno de Enrique Peñalosa, donde se encargó de las relaciones con el Congreso y con los entes nacionales.
En el sector financiero Felipe Muñoz ocupó cargos en el Banco Colpatria y en la Corporación Financiera Unión.