En las veredas El Recreo y Galilea del municipio de Puerto Guzmán (Putumayo) inicialmente se informó que no había iniciado la votación, pues guerrilleros de las Farc no han permitido la jornada en las cuatro mesas destinadas para ello. Según la Policía, el sitio no estaba vigilado.
Por otro lado, según el Javier Rosero Pai, secretario de Gobierno Departamental, en un puesto del colegio San José de Orito en el bajo Putumayo, el jurado entregó a un votante un tarjetón que ya estaba marcado
Pese a que Rosero no precisó si el tarjetón era para Senado o Cámara dijo a Caracol Radio que el hecho ya fue denunciado ante las autoridades electorales. Además, aseguró que la jornada electoral no ha tenido gran acogida por las fuertes lluvias en esa región del país.
En el departamento de Putumayo hay 82 mesas de votación vigiladas por las Fuerzas Armadas y 11 corregimientos que no cuentan con los mecanismos de seguridad para la jornada.
Al final de la jornada, Luis Fernando Arboleda, presidente de Findeter y delegado del Gobierno confirmó a El Espectador, que en este departamento, si bien se comenzó la jornada un en Puerto Guzmán comenzó dos hora tarde, la jornada se desarrolló con toda normalidad.